MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_2

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022649	TCTAC	2	10	16	25	20 %	40 %	0 %	40 %	556555084
2	NC_022649	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	556555084
3	NC_022649	GCGT	2	8	91	98	0 %	25 %	50 %	25 %	556555084
4	NC_022649	TGC	2	6	115	120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
5	NC_022649	CTTAGA	2	12	122	133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556555084
6	NC_022649	ACG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555084
7	NC_022649	CA	3	6	583	588	50 %	0 %	0 %	50 %	556555084
8	NC_022649	CCAG	2	8	778	785	25 %	0 %	25 %	50 %	556555084
9	NC_022649	CTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
10	NC_022649	AAG	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555084
11	NC_022649	ATC	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555084
12	NC_022649	TCG	2	6	903	908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555084
13	NC_022649	GCG	2	6	921	926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555084
14	NC_022649	A	6	6	1148	1153	100 %	0 %	0 %	0 %	556555085
15	NC_022649	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555083
16	NC_022649	A	6	6	2755	2760	100 %	0 %	0 %	0 %	556555083
17	NC_022649	TGA	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555083
18	NC_022649	TA	4	8	2813	2820	50 %	50 %	0 %	0 %	556555083
19	NC_022649	CAGA	2	8	2860	2867	50 %	0 %	25 %	25 %	556555083
20	NC_022649	A	7	7	2877	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	556555083
21	NC_022649	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555086
22	NC_022649	CCG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555086
23	NC_022649	CA	3	6	3072	3077	50 %	0 %	0 %	50 %	556555086
24	NC_022649	CCCA	2	8	3105	3112	25 %	0 %	0 %	75 %	556555086
25	NC_022649	GACT	2	8	3219	3226	25 %	25 %	25 %	25 %	556555086
26	NC_022649	TCT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555086
27	NC_022649	TCTG	2	8	3538	3545	0 %	50 %	25 %	25 %	556555087
28	NC_022649	TC	3	6	3555	3560	0 %	50 %	0 %	50 %	556555087
29	NC_022649	CAT	2	6	3586	3591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
30	NC_022649	ATG	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555087
31	NC_022649	CAT	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
32	NC_022649	CGT	2	6	3780	3785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555087
33	NC_022649	TGAG	2	8	3909	3916	25 %	25 %	50 %	0 %	556555087
34	NC_022649	CAT	2	6	4009	4014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
35	NC_022649	TCA	2	6	4027	4032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555087
36	NC_022649	CGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
37	NC_022649	GCC	2	6	4233	4238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555087
38	NC_022649	CCA	2	6	4371	4376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555087
39	NC_022649	GAA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555088
40	NC_022649	CGGAT	2	10	4615	4624	20 %	20 %	40 %	20 %	556555088
41	NC_022649	TCA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555088
42	NC_022649	GACAGA	2	12	4655	4666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	556555088
43	NC_022649	A	7	7	4742	4748	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088
44	NC_022649	CGAA	2	8	4770	4777	50 %	0 %	25 %	25 %	556555088
45	NC_022649	A	7	7	4806	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088
46	NC_022649	ACG	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555088
47	NC_022649	GCTAT	2	10	4896	4905	20 %	40 %	20 %	20 %	556555088
48	NC_022649	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	556555088

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.